產(chǎn)品名稱】
通用名稱:牛結(jié)節(jié)性皮膚病熒光PCR檢測(cè)試劑盒(實(shí)時(shí)熒光PCR法)
英文名稱:Lumpy skin disease virus Detection Kit (Real-Time PCR Method)
【包裝規(guī)格】 50T/盒
【預(yù)期用途】
本試劑盒利用實(shí)時(shí)熒光PCR原理,定性檢測(cè)LSDV,對(duì)LSDV引起的牛的疫病的診斷和監(jiān)控具有重要指導(dǎo)意義。
【原 理】
本試劑盒針對(duì)LSDV高度保守區(qū)域設(shè)計(jì)特異性引物和探針,在反應(yīng)體系中含LSDV基因組模板的情況下,PCR反應(yīng)得以進(jìn)行并釋放熒光信號(hào)。利用儀器對(duì)PCR過(guò)程中相應(yīng)通道的信號(hào)強(qiáng)度進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)和輸出,實(shí)現(xiàn)檢測(cè)結(jié)果的定性分析。
【試劑盒組成】
序號(hào) | 組成 | 50T/盒 |
1 | LSDV PCR反應(yīng)液 | 1000 μL×1管 |
2 | LSDV 陽(yáng)性對(duì)照 | 40 μL×1管 |
3 | LSDV 陰性對(duì)照 | 40 μL×1管 |
4 | 說(shuō)明書 | 1份 |
注:陰性對(duì)照為滅菌純水,陽(yáng)性對(duì)照為含牛結(jié)節(jié)性皮膚病靶基因的質(zhì)粒。
【儲(chǔ)存條件及有效期】避光-20℃以下保存,避免反復(fù)凍融,有效期12個(gè)月。
【適用儀器】ABI 系列、Bio-Rad系列、Agilent Stratagene MX系列、Roche LightCycler 480、西安天隆系列、杭州博日系列等多通道實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀。
【樣本要求】
1. 樣品采集及處理
1.1 患畜液體樣品:無(wú)菌采集抗凝血或血清、精液或細(xì)胞懸浮液5 mL。
1.2 患畜組織樣品:包括皮膚、肺、脾臟、淋巴結(jié)、肌肉等組織樣品。2~8℃低溫運(yùn)輸至實(shí)驗(yàn)室用于檢測(cè)。
2. 樣品處理方法
2.1 組織樣品:包括皮膚、肺、脾臟、淋巴結(jié)、肌肉等。取2g-5g組織樣品切成小塊,加入5ml-10ml預(yù)冷的PBS緩沖液勻漿2min,制成懸液,反復(fù)凍融3次,4℃ 5000r/m離心10min,取上清液待檢;
2.2 液體樣品:抗凝血樣品置離心管中,掌上離心機(jī)離心2 分鐘取上層血漿,待檢。非抗凝血樣品置離心管中,待凝固后,掌上離心機(jī)離心2 分鐘取上層血清,待檢。
2.3 標(biāo)本收集后若不能立即檢測(cè),可置于2~8℃冷藏過(guò)夜保存;如需長(zhǎng)期保存,標(biāo)本應(yīng)凍存于-20℃~-80℃;
標(biāo)本保存期間應(yīng)避免反復(fù)凍融。
【牛結(jié)節(jié)性皮膚病熒光PCR檢測(cè)試劑盒(實(shí)時(shí)熒光PCR法)檢驗(yàn)方法】
1. 試劑準(zhǔn)備(試劑準(zhǔn)備區(qū))
(1)從冰箱中取出試劑盒, 從試劑盒中取出實(shí)驗(yàn)所需試劑,充分融化混勻并瞬時(shí)離心以去除管壁附著液體。
(2)核算當(dāng)次實(shí)驗(yàn)所需要的反應(yīng)數(shù)(n),并根據(jù)如下表所示反應(yīng)體系計(jì)算當(dāng)次實(shí)驗(yàn)所需要的各種試劑量。
n =陰性對(duì)照數(shù)(1T)+陽(yáng)性對(duì)照數(shù)(1T)+誤差預(yù)留量(1T)+樣本數(shù)
單反液配制表(每份) | PCR反應(yīng)液(UNG酶及Taq酶) | 20 μL |
(3)在無(wú)菌離心管中加入上述試劑,充分混勻后瞬時(shí)離心。按照20 μL/管分裝量將試劑分裝至PCR反應(yīng)管。
(4)蓋緊PCR反應(yīng)管蓋后將PCR反應(yīng)管轉(zhuǎn)移至樣本處理區(qū)。剩余試劑放回-20℃以下冰箱冷凍保存。
2.樣本準(zhǔn)備(樣本處理區(qū))
用QIAGEN、Roche公司DNA提取試劑盒提取DNA,具體操作按照其試劑盒說(shuō)明書操作。
3.加樣
在上述制備好的PCR反應(yīng)樣本管中分別加入處理好的待測(cè)標(biāo)本DNA各5μl、終體積25μl/管,蓋好PCR反應(yīng)蓋混勻后瞬時(shí)低速離心,轉(zhuǎn)移到PCR儀器上。陰性對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照管則各加5μL試劑盒自帶的陰性對(duì)照或陽(yáng)性對(duì)照品,終體積為25μl/管,蓋好PCR反應(yīng)蓋混勻后瞬時(shí)低速離心,轉(zhuǎn)移到PCR儀器上。
4. PCR(PCR擴(kuò)增區(qū))
反應(yīng)體積 | 25 μL | 通道選擇 | FAM通道采集LSDV熒光信號(hào) |
PCR 反應(yīng) 條件 | 步驟 | 條件 | 循環(huán)數(shù) |
UNG處理 | 37℃:2分鐘(min) | 1 | |
預(yù)變性 | 95℃:3分鐘(min) | 1 | |
PCR擴(kuò)增 | 95℃:5秒(s) | 40 | |
58℃:40秒(s) (此階段結(jié)束時(shí)采集熒光信號(hào)) |
(1)取樣本處理區(qū)準(zhǔn)備好的PCR反應(yīng)管,放置在實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀樣品槽相應(yīng)位置,并記錄放置順序。
(2)按下表設(shè)置儀器核酸擴(kuò)增相關(guān)參數(shù)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
注:ABI系列熒光PCR儀在設(shè)置時(shí)不選ROX校正,設(shè)置淬滅基團(tuán)選擇None。
【參考值(參考范圍)】
1.試劑盒有效性判定:
(1)陽(yáng)性對(duì)照:有典型S型擴(kuò)增曲線或Ct值≤35。
(2)陰性對(duì)照:Ct值>38或無(wú)Ct值,線形為直線或輕微斜線,無(wú)指數(shù)增長(zhǎng)期。
2.標(biāo)本結(jié)果判定:
(1)陽(yáng)性:標(biāo)本檢測(cè)結(jié)果Ct值≤35或有明顯指數(shù)增長(zhǎng)期。
(2)可疑:標(biāo)本檢測(cè)結(jié)果Ct值在35~38范圍內(nèi)。此時(shí)應(yīng)對(duì)標(biāo)本進(jìn)行重復(fù)檢測(cè),如重復(fù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果Ct值仍在35~38范圍內(nèi),有明顯指數(shù)增長(zhǎng)期,則判定為陽(yáng)性,否則為陰性。
(3)陰性:標(biāo)本檢測(cè)結(jié)果Ct值>38或無(wú)Ct值。
【檢驗(yàn)結(jié)果的解釋】
通道及檢測(cè)結(jié)果 | 標(biāo)本檢測(cè)結(jié)果解釋 |
FAM | |
+ | 標(biāo)本中檢出LSDV |
- | 標(biāo)本中未檢出LSDV |
【檢驗(yàn)方法的局限性】
1. 當(dāng)檢測(cè)樣本中被檢核酸濃度低于本試劑盒的最低檢出限時(shí)可能會(huì)發(fā)生假陰性的結(jié)果。
2. 被檢樣本在采集、運(yùn)輸、儲(chǔ)存以及處理過(guò)程中操作方式不當(dāng)容易造成RNA降解而產(chǎn)生假陰性結(jié)果。
3. 樣本在采集、運(yùn)輸、儲(chǔ)存以及處理過(guò)程中發(fā)生交叉污染,則容易得到假陽(yáng)性結(jié)果。
【產(chǎn)品性能指標(biāo)】 產(chǎn)品的最低檢出限為103Copies/mL,產(chǎn)品CV值≤3%。
【牛結(jié)節(jié)性皮膚病熒光PCR檢測(cè)試劑盒(實(shí)時(shí)熒光PCR法)注意事項(xiàng)】
1. 使用本試劑盒的實(shí)驗(yàn)室,應(yīng)嚴(yán)格按照國(guó)家有關(guān)部分頒布的有關(guān)基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室管理規(guī)范進(jìn)行管理;
2. 為避免RNA降解,樣本處理過(guò)程應(yīng)在0-4℃條件下操作,且完成實(shí)驗(yàn)后立即上機(jī)檢測(cè);樣本處理過(guò)程中使用的器具耗材應(yīng)經(jīng)過(guò)無(wú)核酶處理;
3. 各區(qū)域物品均為專用,不得交叉使用,以免污染;檢測(cè)結(jié)束后,應(yīng)立即對(duì)工作臺(tái)清潔;
4. 吸取反應(yīng)液時(shí),應(yīng)盡量避免產(chǎn)生氣泡;上 PCR 儀前,應(yīng)注意檢查各反應(yīng)管是否蓋緊,以免液體蒸發(fā)造成結(jié)果不準(zhǔn)確;
5. 試劑盒所有試劑在使用前應(yīng)該在常溫下充分融化混勻,并應(yīng)瞬時(shí)離心;
6. 試劑盒內(nèi)所配陰性和陽(yáng)性對(duì)照在第一次使用前應(yīng)全部轉(zhuǎn)移至標(biāo)本準(zhǔn)備區(qū),并單獨(dú)存放;
7. 為防止熒光干擾,應(yīng)避免裸手直接接觸PCR反應(yīng)管,并應(yīng)避免在PCR反應(yīng)管上進(jìn)行任何標(biāo)記;
8. 檢測(cè)過(guò)程中使用過(guò)的吸頭,應(yīng)直接打到盛有 10%次氯酸的廢物缸內(nèi),檢測(cè)結(jié)束的PCR 反應(yīng)管,切忌開蓋,并與其他廢棄物品一同滅菌后丟棄;工作臺(tái)及各種實(shí)驗(yàn)用品應(yīng)定期用 10%次氯酸、75%酒精或紫外燈進(jìn)行消毒;
9.儀器擴(kuò)增相關(guān)參數(shù)應(yīng)按照本說(shuō)明書相關(guān)要求進(jìn)行設(shè)置;不同批號(hào)試劑不能混用;并在有效期內(nèi)使用。