本產(chǎn)品是專門用于從富含多糖、糖蛋白、粘蛋白的動(dòng)物樣品(尤其是昆蟲樣品)中提取總 RNA 的試劑。該產(chǎn)品特點(diǎn)如下:
1. 操作簡單快速,處理一個(gè)樣品只需要約十分鐘。
2. RNA 純度高,平均 OD260/280 一般都在 2.0 左右,能夠有效去除大多數(shù)昆蟲中的多糖污染。
3. 適用于各種昆蟲組織,每 100mg 組織能提取到 20-30ug 總 RNA。
4. 得到的 RNA 可直接用于 RT-PCR、Northern 雜交、cDNA 合成等實(shí)驗(yàn)。
一站式,提供 RNase-free 的樣品收集管
成 份 | 編 號 | 大紙盒包裝 |
柱式昆蟲RNAout溶液 A | 81220A | 50 mL |
柱式昆蟲RNAout溶液 B | 81220B | 15 mL |
柱式昆蟲RNAout溶液 C | 81220C | 50 mL |
離心吸附柱 | 60911 | 50 套 |
通用洗柱液 | 60408 | 50 mL |
RNA 洗脫液 | 71207 | 10 mL |
使用手冊 | 81220sc | 1 份 |
1. 將 50-300mg 昆蟲組織放入 10-15 mL 塑料離心管中,加入 1 mL 溶液 A, 然后用勻漿器勻漿 5-20 秒。勻漿時(shí)會(huì)產(chǎn)生泡沫,但不影響提取效果。也可以使用液氮硯磨法破碎昆蟲組織,硯磨完后加入 1 mL 溶液 A。注意:溶解溶液 A 沉淀。溶液 A 在 4℃放置后可能會(huì)產(chǎn)生沉淀,使用前必須放在 65℃ 水浴使沉淀徹底溶解并充分搖勻后再取用。
2. 將勻漿物或硯磨物轉(zhuǎn)移至干凈的 1.5 mL 塑料離心管中(可以不必轉(zhuǎn)移非液體的細(xì)胞碎片)。
3. 在離心管中加入 0.3 mL 的溶液 B 和 0.2 mL 自備氯仿,在振蕩器上振蕩30 秒混勻,此時(shí)溶液呈均勻的乳濁狀。振蕩器振蕩時(shí)必須使管底溶液震蕩起來。
4. 室溫 12,000 rmp 離心 3-5 分鐘,兩相間將有約 5-10 毫米厚的細(xì)胞破碎物。
將上清液(約 0.6 mL)轉(zhuǎn)移到另一干凈的 1.5 mL 塑料離心管中,下層有機(jī)相和中間層含有 DNA、蛋白質(zhì)和其他雜質(zhì),避免觸及或吸取。最好留下 100 uL 上清液不取。
6. 加入等體積的溶液 C,充分顛倒混勻。
7. 將一半的溶液轉(zhuǎn)移到離心吸附柱中,12,000 rmp 室溫離心半分鐘,棄穿透液。
8. 將剩下的一半溶液轉(zhuǎn)移到同一離心吸附柱中, 12,000 rmp 室溫離心半分鐘,棄穿透液。
9. 加 0.7 mL 通用洗柱液,室溫 12,000 rmp 離心半分鐘,棄穿透液。
10. 加 0.3 mL 通用洗柱液,室溫 12,000 rmp 離心半分鐘,棄穿透液。此步可以省略。
11. 室溫 12,000 rmp 離心半分鐘。此步十分重要,否則殘留的乙醇會(huì)影響 RNA的使用。
12. 將離心吸附柱轉(zhuǎn)移到 RNase-free 收集管中,加入 50-100 uL RNA 洗脫液,室溫放置 1-2 分鐘。
13. 12,000 rmp 室溫離心半分鐘,離心管中溶液即為 RNA 樣品,可以立即使用或存放于-80℃待用。
14. RNA 完整性的電泳檢測:如果需要做 Northern 雜交,強(qiáng)烈建議用戶使用甲醛變性膠進(jìn)行 RNA 電泳, 因?yàn)榉亲冃阅z不能分離所有的 RNA 分子
(BioTechniques,28:414,2000)。注意:大部分昆蟲的 28S RNA 被
切割成兩個(gè)小的片段,彼此用氫鍵相連,所以在甲醛變性膠中,沒有 28S 帶出現(xiàn)( 文獻(xiàn)見: Eva C. Winnebeck, Craig D. Millar and Guy R. Warman, Why does insect RNA look degraded? Journal of Insect Science: Vol. 10:1-7)
15. RNA 產(chǎn)量產(chǎn)率測定:將 5-10 μL RNA 溶于 TE 緩沖液中(pH7.5-8.2 之間)檢測其在 OD260 的光吸收。通過光吸收可以得出 RNA 濃度(1 OD260 的RNA=40 μg/mL),進(jìn)而計(jì)算出 RNA 的產(chǎn)量(濃度 X 體積)和產(chǎn)率(RNA 產(chǎn)量/組織用量)。
16. RNA 純度測定:無污染的總 RNA 的 OD260/OD280 一般在 1.8-2.1 之間
(具體數(shù)值與其堿基組成和溶液成分等多種因素有關(guān)),高于此范圍則分別表 示樣品可能有蛋白質(zhì)污染,但一般不影響 RT-PCR 等反應(yīng)。