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大提無內(nèi)毒素質(zhì)粒 DNAOUT

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CAT#:81107-50

常溫運輸和保存  (部分低溫)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

大提無內(nèi)素質(zhì)粒 DNAOUT      Endo-free Max Column Plasmid DNAout

使用手冊 V1.5


產(chǎn)品及特

本試劑盒采用改進(jìn) SDS-堿裂解法裂解細(xì)胞,通過獨特的內(nèi)毒素清除劑選擇性結(jié) 合離除去內(nèi)毒素,然后離心吸附柱內(nèi)的硅基質(zhì)膜在高鹽、低 pH 值狀態(tài)下選擇性地 結(jié)合溶液中的質(zhì)粒 DNA ,再通過去蛋白液和漂洗液將雜質(zhì)和其它細(xì)菌成分去除  后低鹽、高 pH 值的洗脫緩沖液將純凈質(zhì)粒 DNA 從硅基質(zhì)膜上洗脫 。操作簡單 在經(jīng)典的柱式質(zhì)粒 DNA 提取前 ,增加菌體內(nèi)毒素清除一步。

1.    離心吸附柱內(nèi)硅基質(zhì)膜全部采用進(jìn)口世界著名公司特制吸附膜,柱與柱之間吸

量差異極小 ,可重復(fù)性好 。克服了國產(chǎn)試劑盒膜質(zhì)量不穩(wěn)定的弊。

2.    獨特工藝配方清除內(nèi)毒素  內(nèi)毒素含量極低  (<0. 1 EUg DNA) ,細(xì)胞轉(zhuǎn)染效

果極佳 也可直接用于酶切、轉(zhuǎn)化、PCR、體外轉(zhuǎn)錄、測序、等各種分子生物學(xué)

驗。

規(guī)格及成分

試劑盒組成、儲存、穩(wěn)定性

 

 

保存

 

紙盒包裝

 

衡液

90901

5ml

RNase A  (10mg/ml)

-20

60205a

150µl

溶液 P1

4℃

60205b

15 ml

溶液 P2

60205c

15 ml

 N3

3160

15 ml

 

蛋白液 PE

 

90303

16 ml

第一次使用前按說明

加指定量乙醇

內(nèi)毒素清除劑

-20

60408

5 ml

 

洗液 WB

 

1 1 1205

13 ml

第一次使用前按說明

加指定量乙醇

脫緩沖液 EB

1 1 1206

15 ml

附柱 AC

1 1 1207

50 

收集管 (2ml)

1 1 1208

50 

使用手冊

 

81107sc

1 

輸及保存

本試劑盒在室溫儲存 12 個月不影響使用效果。

內(nèi)毒素清除劑常溫運輸  4 度可以保存一個月 ,長期保存放-20℃。

存事項:

1.   RNaseA 保存在即用型甘油緩沖液中 ,常溫運輸 ,收到后 ,不超過 25℃室溫 少保 6 個月 ,  4 ℃保存 12 個月 ,長期保存放-20℃。

2.      使              RNase A     P1   (終   100ug/ml)  置于 2-8 ℃保存 。如果溶液 P1 中 RNase A 失活 ,提取的質(zhì)? 能會有微 RNA 殘留 ,在溶液 P1 中補加 RNase A 即可。

 


 

3.      環(huán)境溫度低時溶液 P2 中 SDS 可能會析出渾濁或者沉淀,可在 37℃水浴加熱

分鐘 ,  即可恢復(fù)澄清 ,不要劇烈搖晃 ,  以免形成過量的泡沫。

4.      避免試劑長時間暴露于空氣中產(chǎn)生揮發(fā)、氧化、pH 值變化 ,各溶液使用后應(yīng)

蓋緊蓋子。

使用方法

步驟:  (實驗前請先閱讀注意事項)

提示:

    第一次使用前請先在漂洗液 WB 瓶中加入指定量無水乙醇 ,充分混勻 ,  

入后請及時在方框打鉤標(biāo)記已加入乙醇 ,  以免多次加入!

     RNase A 全部加入溶液 P1 中 ,混勻 ,每次使用后置于 2-8 ℃保存。

1.   取 1.5-4.5 ml 過夜培養(yǎng)的菌液 ,  12,000 rpm 離心 30 秒 ,盡可能的倒干上清, 集菌體。

收集超過 1.5 ml 菌液 ,   可以離心棄上清后 ,在同一個 1.5ml 管內(nèi)加入更多的 菌液 ,重復(fù)步驟 1 ,直到收集到足夠的菌。

2.    250μl 溶液 P1 重懸菌體沉淀 ,渦旋振蕩至徹底懸浮。

如果有未徹混勻的菌塊 ,會影響裂解 ,導(dǎo)致提取量和純度偏低。

3.    250μl 的溶液 P2 ,溫和地上下翻轉(zhuǎn) 6 -8 次使菌體充分裂解 ,室溫放置 4 分 鐘。

溫和地混合 ,不要劇烈震蕩 ,  以免基因組 DNA 剪切斷裂  所用時間不應(yīng)超過 5 分鐘!以免質(zhì)粒受到破壞 。此時菌液應(yīng)變得清亮粘稠,如果菌體少,很快清亮 稠后就可做下一步 ,不是一定要準(zhǔn)確的 5 分鐘。

4.   加 250μl 溶液 N3 ,立即溫和地上下翻轉(zhuǎn) 6 -8 次 ,充分混勻時會出現(xiàn)白色絮 沉淀 。  12,000 rpm 離心 10 分鐘 ,小心取上清至新管 ,避免吸取到漂浮白色沉 淀。

加入溶液 N3 后應(yīng)該立即混勻 ,  以免產(chǎn)生 SDS 的局部沉淀。

5.   加入 0. 1 體積(上清的體積的 10%,約 80µl)的內(nèi)毒素清除劑到上一步所得上, 顛倒旋轉(zhuǎn)混勻,冰浴或者插入碎冰中(或冰箱冷凍室)放置 5 分鐘直到渾濁變清 透明  (或仍舊稍有渾濁) ,  中間偶爾混勻幾次。

內(nèi)素清除劑加入上清后,上清會變得渾濁,但是冰浴后應(yīng)恢復(fù)清亮(或稍渾濁) 

6.   常溫放置 3-5 分鐘 ,溫度恢復(fù)室溫溶液很快變?yōu)闇啙?,顛倒混。

如室內(nèi)溫較低或者想加快速度可以在 37-42℃水浴 ,將很快變渾濁 ,顛倒混 。

7.   室溫 12,000 rpm 離心 10 分鐘分相  。  上層水相含 DNA ,  下層藍(lán)色油狀相 內(nèi)毒素其它雜質(zhì) 。將含 DNA 的上層水相轉(zhuǎn)移到新管  (注意不要吸到藍(lán)色油狀  ,里面含內(nèi)毒素等雜質(zhì)) ,棄油狀層。

衡液預(yù)處理吸附柱:

使用平衡液預(yù)處理硅膠膜吸附柱為必做步驟,具體方法參見前文“關(guān)于平衡液

使用

8.   向上層水相中加入 0.5 體積異丙醇  (約 370µl)  后充分顛倒混勻后分兩次  (每 次不超過 700µl)  轉(zhuǎn)入吸附柱 AC   (吸附柱放入收集管中) ,  12,000 rpm   1 分鐘 ,倒掉收集管中的廢液 。直到所有混合溶液通過此吸附柱。

9.   加入 500μl 去蛋白液 PE ,  12,000 rpm 離心 30 秒 ,棄廢液。

此步驟為了去除痕量核酸酶等雜質(zhì) ,如所用菌株為 JM 系列、  HB101  endA 菌株或野生型菌株 ,核酸酶含量豐富 ,應(yīng)加此步驟;  如所用菌株為 XL- 1 Blue、 Top10  DH5α等缺陷型菌株 ,核酸酶含量低 ,則可略過此步驟。

10. 加入 600μl 漂洗液 WB  (請先檢查是否已加入無水乙醇!) ,  12,000 rpm 離心

30 ,棄掉廢液 。再加入 600μl 漂洗液 WB ,重復(fù)漂洗一次。

 


 

1 1. 將吸附柱 AC 放回空收集管中,12,000 rpm 離心 2 分鐘,盡量除去漂洗液 ,   以 洗液中殘留乙醇抑制下游反應(yīng)。

12. 取出吸附 AC ,放入一個干凈的離心管中 在吸附膜的中間部位 50- 100μl 洗脫緩 EB  (洗脫緩沖液事先在 65-70℃水浴中加熱效果更好) ,室溫放置

2 分 ,  12,000 rpm 離心 1 分鐘 。如果需要較多量質(zhì)粒 ,可將得到的溶液重 新加入離心吸附柱中 ,室溫放置 2 分鐘 ,離心 1 分鐘。

洗脫體積越大,洗脫效率越高。如果需要質(zhì)粒濃度較高,可以適當(dāng)減少洗脫體積, 但是最小體積不應(yīng)少于 30μl ,體積過小降低質(zhì)粒洗脫效率 ,減少質(zhì)粒產(chǎn)量。

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

意事項

1.   所有的離心步驟均在室溫完成 ,使用轉(zhuǎn)速可以達(dá)到 13,000rpm 的傳 統(tǒng)臺離心機 ,如 Eppendorf 5415C 或者類似離心機。

2.   提取質(zhì)粒的量與細(xì)菌培養(yǎng)濃度、質(zhì)?截悢(shù)等因素有關(guān) 。一般高拷貝 質(zhì)粒,建議接種單菌落于 1.5-4.5 ml 加合適抗生素的 LB 培養(yǎng)基 ,   夜培養(yǎng) 14- 16 個小時 ,可提取出多達(dá) 20µg-50µg 的純凈質(zhì)粒 。如果 所提質(zhì)粒為低拷貝質(zhì);虼笥 10kb 的大質(zhì)粒 ,應(yīng)適當(dāng)加大菌體使用 量,使用 5- 10 ml 過夜培養(yǎng)物,同時按比例增加 P1、P2、N3 的用量, 它步驟相同。

3.   得到的質(zhì)粒 DNA 可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計檢測濃度與 純度 。  OD260 值為 1 相當(dāng)于大約 50μg/ml DNA 。  電泳可能為單一  ,也可能為 2 條或者多條 DNA 條帶 ,這主要是不同程度的超螺 旋構(gòu)質(zhì)粒泳動位置不一造成 ,與提取物培養(yǎng)時間長短、提取時操作 烈程度等有關(guān) 。  本公司產(chǎn)品正常操作情況下基本超螺旋可以超過 90%。

4.   質(zhì)粒 DNA 確切分子大小     必須酶切線性化后 ,  對比 DNA 分子量 Marker 才可以知道  處于環(huán)狀或者超螺旋狀態(tài)的的質(zhì)粒 ,  動位置 不確 ,無法通過電泳知道其確切大小。

5.   洗脫液 EB 不含有螯合劑 EDTA ,不影響下游酶切、連接等反應(yīng)  可以使用水洗脫 ,但應(yīng)該確保 pH 大于 7.5 ,pH 過低影響洗脫率。 洗脫質(zhì)粒應(yīng)該保存在- 20℃ 。質(zhì)粒 DNA 如果需要長期保存 ,可 以用 TE 緩沖液洗脫  ( 10mM Tris-HCl ,    1mM EDTA ,pH 8.0) , 但是 EDTA 可能影響下游酶切反應(yīng) ,使用時可以適當(dāng)稀釋。

關(guān)于平衡液的使用

 核酸吸附硅膠膜柱子長期放置過程中會同空氣中的電荷/塵 埃發(fā)生應(yīng)而影響其核酸的結(jié)合能力 。硅膠柱經(jīng)平衡液預(yù)處理后可大大減 少柱中硅膠膜的憎水基團(tuán) ,提高核酸的結(jié)合能力 。從而提高硅膠柱子回 率或者產(chǎn)量 。平衡液是強堿性溶液 ,若不小心碰到 ,請用大量自來水 清洗 。  用完后需蓋緊瓶蓋  以免接觸空氣 。  室溫保存 。在保存過程中可能 有沉生成 ,請加熱至 37℃使沉淀完全消失。

使用方法:取一個新的硅膠膜吸附柱子裝在收集管中 ,吸取 100μl 的平衡液至柱子中  12,000 rpm 離心 1 分鐘 ,倒掉收集管中廢液 ,將吸 柱子重新放回收集管。此時平衡液預(yù)處理柱子完畢。接后續(xù)的操作步驟。

關(guān)聯(lián)產(chǎn)品

內(nèi)毒素質(zhì)粒 DNAOUT

20180330dx

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