產(chǎn)品及特點(diǎn)
本產(chǎn)品是動(dòng)物總 RNA 快速提取試劑動(dòng)物 RNAOUT(CAT#:3070)的柱式升級(jí)產(chǎn)品,可用于從各種動(dòng)物組織(包括白細(xì)胞)快速提取總 RNA。跟動(dòng)物 RNAOUT 相比其主要特點(diǎn)是:
1. 操作更加簡單快速,整個(gè)過程只需要不到十分鐘(對(duì)一個(gè)樣品而言)。
2. RNA 純度更高,OD260/OD280 一般在 2.0 左右。
3. 一般不含用 RT-PCR 可以檢測到的基因組 DNA 污染。
4. 適用于培養(yǎng)細(xì)胞、大部分動(dòng)物組織和部分植物組織。
5. 得到的 RNA 可直接用于 RT-PCR、Northern 雜交、cDNA 合成等實(shí)驗(yàn)
6. 性價(jià)比高于進(jìn)口的柱式 RNA 提取產(chǎn)品。
7. 可以進(jìn)行無氯仿操作,只是純度稍微降低,但不影響使用。
使用方法
下面的操作步驟是針對(duì)在 1.5 mL 塑料離心管中進(jìn)行的微量提取的,如果處理樣品量大,請(qǐng)按比例增加各成份的用量并使用大的離心管和離心機(jī)。
1. 根據(jù)組織細(xì)胞類型的不同分為下面及種情況使用:
a) 對(duì)貼壁細(xì)胞:吸盡培養(yǎng)液,在每 10 平方厘米細(xì)胞中加入 1 mL 柱式動(dòng)物RNAout 溶液 A,用槍輕柔吹打數(shù)次,確保細(xì)胞全部裂解并且讓基因組DNA 充分?jǐn)嗔选?/span>
b) 對(duì)懸浮細(xì)胞:離心收集細(xì)胞,吸盡液體,在每 1-5×106懸浮細(xì)胞中加入1 mL 柱式動(dòng)物 RNAout 溶液 A,用槍輕柔吹打數(shù)次,確保細(xì)胞全部裂解并且讓基因組 DNA 充分?jǐn)嗔。如果?fibroblasts 或 carcinoma cell,1 mL 溶液 A 的細(xì)胞使用量不要超過 1×106個(gè)細(xì)胞。
c) 對(duì)新鮮組織:先將剪切成小塊新鮮組織或液氮保存的組織放入 10 mL 或15 mL 塑料離心管中,每 50-100 mg 組織加 1 mL 柱式動(dòng)物 RNAout溶液 A,用 Polytron 剪切式勻漿器勻漿 30 秒左右。對(duì)肝、脾、胰、腎等細(xì)胞分裂十分旺盛的組織(細(xì)胞中含大量正在復(fù)制的 DNA),建議組織的使用量不要超過 50 mg/ mL 柱式動(dòng)物 RNAout 溶液 A,否則十分容易產(chǎn)生 DNA 污染。也可以用液氮研磨:在研缽中加入液氮,再加入 50-100mg新鮮組織,然后研磨粉后轉(zhuǎn)移到 1.5mL 離心管中,再加入 1mL 柱式動(dòng)物 RNAout 溶液 A,震蕩 30 秒混勻。
d) 對(duì) RNALOCKER 保存組織:先用紙吸去 RNALOCKER 液體后再剪切成小塊,其余操作同新鮮組織的處理。
2. 如果進(jìn)行無氯仿操作(所得 RNA 純度稍低,但一般不影響后續(xù)使用),則將上步所得的細(xì)胞裂解物或勻漿液轉(zhuǎn)移至一個(gè)干凈的 1.5 mL 塑料離心管中,12,000 rpm 室溫離心 3-5 分鐘。
3. 如果進(jìn)行帶氯仿操作(所得 RNA 純度比免氯仿操作稍高),則將上步所得的細(xì)胞裂解物或勻漿液轉(zhuǎn)移至一個(gè)干凈的 1.5 mL 塑料離心管中,然后加入0.2倍體積的自備氯仿(1 mL柱式動(dòng)物RNAout溶液A需0.2 ml氯仿),振蕩器充分振蕩混均 30 秒,12,000 rpm 室溫離心 3-5 分鐘。
4. 將上清液轉(zhuǎn)移到一個(gè)干凈的 2 mL 塑料離心管中。注意:無氯仿操作時(shí),離心后管底是細(xì)胞碎片和結(jié)締組織纖維。帶氯仿操作時(shí),離心后分上下層,下層有機(jī)相和上下層中間含有 DNA 和蛋白質(zhì),吸取上清時(shí)避免觸及,否則將產(chǎn)生蛋白質(zhì)和 DNA 污染。為保險(xiǎn)起見,可以留下 100 uL 上清液不取。同時(shí)吸取上清時(shí)最好緩慢進(jìn)行。
5. 加入等體積的柱式動(dòng)物 RNAout 溶液 B,充分顛倒混勻。
6. 分次(一般需要 2-3 次)將加入柱式動(dòng)物 RNAout 溶液 B 后的混合液轉(zhuǎn)移到離心吸附柱中,12,000 rpm 室溫離心半分鐘,棄穿透液。如果溶液粘稠,可以延長離心時(shí)間到 2 分鐘。
7. 加 0.7 mL 通用洗柱液到離心吸附柱中,12,000 rpm 室溫離心半分鐘,棄收集管中的穿透液。一次洗滌一般足夠去除雜質(zhì)。
8. 再加 0.3 mL 通用洗柱液到離心吸附柱中,12,000 rpm 室溫離心半分鐘,棄穿透液。此步可以省略。
9. 再室溫 12,000 rmp 干甩半分鐘。此步十分重要,否則殘留的通用洗柱液會(huì)影響 RNA 的使用。
10. 將離心吸附柱轉(zhuǎn)移到一自備的 RNase-free1.5mL 塑料離心管中,加入50-100 uL RNA 洗脫液。
11. 室溫 12,000 rmp 離心半分鐘,離心管中溶液即為 RNA 樣品,可以立即使用或存放于-80℃待用。
12. RNA 的電泳檢測:本試劑盒提取的 RNA 最好用甲醛變性膠電泳,如果在非變性的普通瓊脂糖膠(in TAE 或 TBE buffer)上電泳,一定要使用RNA 專用上樣液 RNAon(操作詳見 RNAon 使用手冊(cè)),千萬不要使用常用的 DNA 上樣液,因?yàn)?DNA 上樣液沒有經(jīng)過去 RNase 處理,也不能將 RNA 變性,得到的帶型將十分雜亂。
13. RNA 完整性的電泳檢測:如果需要做 Northern 雜交,強(qiáng)烈建議用戶使用甲醛變性膠進(jìn)行 RNA 電泳,因?yàn)榉亲冃阅z不能分離所有的 RNA 分子(BioTechniques,28:414,2000)。
14. RNA 產(chǎn)量產(chǎn)率測定:將 5-10 μL RNA 溶于 TE 緩沖液中(pH7.5-8.2 之間)檢測其在OD260的光吸收。通過光吸收可以得出RNA濃度(1 OD260的 RNA=40 μg/mL),進(jìn)而計(jì)算出 RNA 的產(chǎn)量(濃度 X 體積)和產(chǎn)率(RNA產(chǎn)量/組織用量)。
15. RNA 純度測定:無污染的總 RNA 的 OD260/OD280 一般在 1.8-2.1 之間(具體數(shù)值與其堿基組成和溶液成分等多種因素有關(guān)),高于此范圍則分別表示樣品可能有蛋白質(zhì)污染,但一般不影響 RT-PCR 等反應(yīng)。
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