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PBCV DNA連接酶

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PBCV DNA 連接酶也稱為SplintR 連接酶或 Chorella 病毒 DNA 連接酶,它能夠高效催化相鄰的 DNA 核苷酸的連接,這個連接過程需要一條互補(bǔ)的 RNA 在兩條 DNA 單鏈間起“夾板”或“橋梁”的固定作用。PBCV DNA連接酶的這種活性遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于傳統(tǒng)的T4 DNA連接酶,有助于miRNAs和mRNAs,包括SNPs在內(nèi)的研究方法的創(chuàng)新。另外,在二代測序和分子診斷等眾多領(lǐng)域中,PBCV DNA連接酶是富集目的基因的理想選擇。它具有穩(wěn)定的生物活性,對 RNA 介導(dǎo)固定的 DNA 底物親和性強(qiáng)(米氏常數(shù) Km = 1 nM),能夠在復(fù)雜的混合物中檢測到亞納摩爾級的特定 RNA。因此,在 RNA 檢測技術(shù)中,PBCV DNA 連接酶不失為最佳選擇用酶。

組分

組分名稱 數(shù)量
PBCV DNA Ligase(25 U/μl) 50μl
10×PBCV Ligation Buffer 250μl

應(yīng)用

  • 單鏈DNA的連接
  • 基于探針法的miRNA的檢測
  • SNP或剪接體的檢測
  • RASL分析

活性定義

1 單位指 20 μl 反應(yīng)體系中,1×PBCV 連接酶反應(yīng)緩沖液,16℃ 條件下,15 分鐘內(nèi)能使 2 pmol 的DNA:RNA 雜交底物連接反應(yīng)完成50%所需的酶量。

反應(yīng)溫度及失活

該酶的最佳反應(yīng)溫度為25度,可在16-37度之間優(yōu)化,37度可明顯提高反應(yīng)的特異性;該酶在65°C 加熱20min即可失活。

儲存

-20℃可保存3年。

使用注意事項

1. 1×PBCV Ligation Buffer:50mM Tris-HCl pH 7.5,5mM MgCl2,0.1mM ATP, 10mM DTT。
2. 該酶對ATP的要求比較寬泛,10-100uM ATP范圍內(nèi)都可發(fā)揮活性,5mM Mg2+可顯著增加連接產(chǎn)物的量,最佳ph為7.5-8.0。
3. 該酶對一價陽離子非常敏感,如Nacl或KCl的濃度應(yīng)低于50mM,100mM的Nacl會完全抑制連接反應(yīng)。
4. 該酶的反應(yīng)溫度為16~37℃,隨著溫度的上升酶活性會提高,但此時腺苷化產(chǎn)物也隨之增加,最佳溫度為25 ℃。
5. 連接效率隨著夾板RNA長度的減少而降低,當(dāng)長度小于等于10nt時,連接效率為零。
6. 供體的5’端第一個堿基為“A/T”時連接效率最高。
7. 受體的3’端第一個堿基為“T”時連接效率最高,3’端第一個堿基為“G”時連接效率最差。
 
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