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細(xì)說(shuō)蛋白樣品制備關(guān)鍵點(diǎn)

發(fā)布時(shí)間:2021/5/10 8:49:41      閱讀次數(shù):876

 蛋白質(zhì)樣品的制備,是蛋白質(zhì)研究的第一步,不論后續(xù)采用何種分離或鑒定手段,樣品制備都是重要步驟。

蛋白質(zhì)樣品制備的意義

  1. 生物的蛋白質(zhì)種類(lèi)多達(dá)10萬(wàn)種以上,樣品中的蛋白質(zhì)種類(lèi)也可達(dá)到1萬(wàn)種以上,但大部分蛋白質(zhì)的拷貝數(shù)很少,因此通過(guò)樣品制備起到濃縮蛋白質(zhì)的作用。

  2. 去除樣品中各種非蛋白質(zhì)的影響。

如何進(jìn)行蛋白質(zhì)的制備

蛋白樣品制備包括蛋白質(zhì)的分離,提取和純化。從各類(lèi)研究角度而言,樣品制備都要盡可能獲得所有樣品中的蛋白質(zhì),但是由于蛋白質(zhì)種類(lèi)多,豐度不一,物化特性多樣等因素,要到達(dá)真正的完全蛋白質(zhì)制備是非常困難的。

在制備中丟失的蛋白是永遠(yuǎn)不可能在后面試驗(yàn)中彌補(bǔ)回來(lái)的!

樣品制備的原則:

  1. 盡可能采用簡(jiǎn)單的方法進(jìn)行樣品的制備。

  2. 盡可能提高樣品的溶解度,使所有待分析的蛋白質(zhì)樣品全部處于溶解狀態(tài),且穩(wěn)定可重復(fù)。

  3. 盡可能減少蛋白的降解。

  4. 根據(jù)下游實(shí)驗(yàn)選擇決定提取蛋白的方法,例如提取變性還是活性蛋白,提取總蛋白還是亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)組分蛋白。

  5. 盡量去除干擾下游應(yīng)用的雜質(zhì),包括但不僅限于核酸,組織碎片,或某些高豐度無(wú)關(guān)蛋白。

樣品制備的基本流程:

  1. 樣品的破碎

  2. 樣品的裂解

  3. 雜質(zhì)的去除及蛋白質(zhì)溶液的獲取

樣品的破碎

為了完全分析細(xì)胞內(nèi)蛋白,樣品必須經(jīng)過(guò)有效的破碎,破碎方法的選擇依賴(lài)于樣品來(lái)源不同(如組織,固定組織,難研磨組織,脂肪,菌體)而不同,同時(shí)也依賴(lài)于提取蛋白的類(lèi)型(如是獲取總蛋白還是特殊的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)組分)。

通常組織樣品和微生物樣品都需要進(jìn)行破碎處理,而細(xì)胞樣品不需要。破碎可以通過(guò)滲透,凍融,酶解,超聲,高壓,液氮研磨,機(jī)械勻漿,玻璃珠勻漿等方式完成。選擇破碎方式時(shí)也要考慮使用的裂解液配方是否可以完美的配合,以得到最佳的提取效果。提取總蛋白時(shí)需要盡量的破碎樣品釋放蛋白,而特殊的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)分離則需要根據(jù)提取方法采用合適的破碎方式。

 

提示:內(nèi)源性的蛋白酶通常存在于細(xì)胞質(zhì)內(nèi),在細(xì)胞破碎時(shí)可能會(huì)釋放出來(lái),導(dǎo)致某些蛋白質(zhì)的降解,從而影響下游實(shí)驗(yàn)結(jié)果,因此可在細(xì)胞裂解前添加蛋白酶抑制劑加以保護(hù)。

樣品的裂解

 

樣品裂解是指對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行增溶性溶解的過(guò)程,可通過(guò)破壞蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)與非蛋白質(zhì)之間的相互作用完成。通常裂解液中會(huì)添加表面活性劑,不同的裂解液配方所能溶解和獲取的蛋白種類(lèi)和得率會(huì)有較大差別,所得到的蛋白譜也會(huì)不同,所以看似簡(jiǎn)單的樣品裂解卻是決定整個(gè)實(shí)驗(yàn)成敗的關(guān)鍵點(diǎn)。優(yōu)質(zhì)的裂解液配方既能實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)間的良好分離,又不影響下游實(shí)驗(yàn)。

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去除雜質(zhì)和蛋白質(zhì)獲取

蛋白樣品中的雜質(zhì)主要包括核酸,脂類(lèi),組織碎片等,這些雜質(zhì)均會(huì)干擾下游實(shí)驗(yàn)。特別是核酸雜質(zhì)會(huì)增加樣品的粘度,可能會(huì)引起下游實(shí)驗(yàn)中凝膠孔堵塞,核酸與蛋白結(jié)合阻礙聚集,銀染或WB背景過(guò)高等問(wèn)題,所以需盡量去除雜質(zhì)。去除雜質(zhì)后即可獲得蛋白質(zhì)溶液。傳統(tǒng)的提取方法(如RIPA裂解液和溶液法提取的試劑盒)缺少有效的雜質(zhì)去除步驟,通過(guò)離心取上清的方式獲取的蛋白質(zhì)無(wú)法完全去除雜質(zhì),且獲得的蛋白純度較低,同時(shí)也會(huì)損失較多蛋白質(zhì),從而影響蛋白的提取質(zhì)量,改變樣品中真實(shí)的蛋白譜。新一代柱式總蛋白提取法突破了傳統(tǒng)方法的困境,利用離心管柱技術(shù),可有效去除蛋白中的核酸雜質(zhì),提高蛋白純度,配合優(yōu)化的裂解液配方,無(wú)蛋白丟失,一管式操作,可快速獲取高質(zhì)量的蛋白質(zhì)樣品。降低下游檢測(cè)難度,提高數(shù)據(jù)真實(shí)性。

 

亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)分離

 

大部分實(shí)驗(yàn)通?梢杂每偟鞍捉M分進(jìn)行蛋白質(zhì)的分析,但是涉及到某些低豐度蛋白或者蛋白細(xì)胞定位和蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)研究時(shí),則需要進(jìn)行樣品的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)分離,也就是將樣品中的蛋白分成幾個(gè)組分,分別進(jìn)行蛋白質(zhì)的研究。根據(jù)蛋白質(zhì)在細(xì)胞中不同的細(xì)胞定位進(jìn)行分離,可分離細(xì)胞核,細(xì)胞膜,內(nèi)質(zhì)網(wǎng),線粒體,高爾基體,溶酶體,內(nèi)體等結(jié)構(gòu)。亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)分離不僅可以提高低豐度蛋白質(zhì)的上樣量,降低檢測(cè)難度,還可以針對(duì)某一細(xì)胞組分的蛋白質(zhì)進(jìn)行分析。傳統(tǒng)的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)分離主要是將樣品勻漿后,進(jìn)行密度梯度離心分離不同組分,傳統(tǒng)提取方法操作步驟多而復(fù)雜,所需起始原料量極大,需使用超高速離心及配制密度梯度溶液,得率較低,失敗率高,使得下游實(shí)驗(yàn)困難增加,阻礙深入研究進(jìn)程。為了加速科研者在蛋白領(lǐng)域深入研究的腳步,打造了柱式法亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)分離平臺(tái),配有全套的動(dòng)植物亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)分離工具,可分離內(nèi)質(zhì)網(wǎng),高爾基體,溶酶體,線粒體,內(nèi)體,細(xì)胞膜,葉綠體,外泌體,微粒體,細(xì)胞核等,僅需極少的樣品,無(wú)需超高速離心,即可獲得高質(zhì)量的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)。

 

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ER-036(內(nèi)質(zhì)網(wǎng))

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Minute™ Golgi Apparatus Enrichment Kit

 

LY-034(溶酶體)

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ED-028(早期內(nèi)體)

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