產(chǎn)品及特點(diǎn)
植物線粒體是重要的植物細(xì)胞器,負(fù)責(zé) ATP 的產(chǎn)生。此外植物很多重要的特性(如雄性不育)也跟線粒體相關(guān),是母系遺傳研究的重要材料。對植物線粒體進(jìn)行生化和遺 傳研究都需要進(jìn)行線粒體純化。本產(chǎn)品就是專門用于植物細(xì)胞線粒體純化的試劑盒, 它具有下列特點(diǎn):
1.即用型試劑盒,用戶不需要單獨(dú)配制各種溶液。
2.提供粗提和精提兩種操作方案,粗提利用常規(guī)臺(tái)式冷凍離心機(jī)的差速分離原理進(jìn)行線粒體粗提,所得線粒體含少量其他細(xì)胞器污染,可用于后續(xù)的 SDS-PAGE, Western,ELSIA 和蛋白組分析,也可以用于 PCR 級(jí)別的線粒體 DNA 和 RNA 提取。
3.精提利用冷凍超速離心(離心力達(dá) 40000g)制備的密度梯度來將粗提制備的線粒體和其他細(xì)胞成分進(jìn)一步分開,得到線粒體精提液,適用于后續(xù)的偶聯(lián)分析、 體外 線粒 體蛋 白合 成、線 粒體 成份 定位 等精細(xì) 實(shí)驗(yàn) 。也 可用 于后續(xù) 的SDS-PAGE、Western、ELSIA、蛋白組分析和測序級(jí)別的線粒體 DNA 和 RNA 提取。
4.本產(chǎn)品足夠 5 次提取,每次可處理 10g 綠色植物組織(可得 1-2.5 mg 左右線粒體)或 20g 非綠色植物組織(可得 2-5 mg 左右的線粒體)。
成分 | 編號(hào) | 大紙盒包裝 |
勻漿液 | 111208A | 250 mL |
洗滌液 | 111208B | 250 mL×2 |
離心介質(zhì)溶液 | 111208C | 150 mL |
Percoll | 17-0891-09 | 50 mL |
BSA 干粉 | 9048-46-8 | 10g |
帶柄尼龍篩 | --- | 1 只 |
軟毛筆 | --- | 1 只 |
使用手冊 | 111208sc | 1 份 |
自備試劑
超純水,可能需要 5 M KOH 調(diào) pH,如果需要去除細(xì)胞核 DNA,還需要自備 25mM MgCl2 溶液、0.5M EDTA 溶液、DNase 干粉和另購更多洗滌液。
使用方法
注意:線粒體膜對溫度高度敏感,所以整個(gè)操作必須在冰上或者在冷室進(jìn)行,所用植物組織,器皿和溶液均需要在 4℃預(yù)冷。任何情況下線粒體的溫度都不要超過 4℃。
一:選擇組織
1.植物組織不同,線粒體產(chǎn)率不同,請以下表為參考:
植物組織種類 | 線粒體產(chǎn)率 | 說明 |
根和塊莖 | 0.3 mg/10g | 如土豆,紅薯等 |
黃化苗(下胚軸、子葉、胚芽鞘) | 2-5 mg/10g | 多酚含量低于葉片 |
有光合作用的葉片和子葉 | 1-2.5 mg/10g | 需放置在暗處 3 天 |
2.一般純化最好選用用黃化苗。如果用綠色組織(如葉片),需將植物提前放在暗室至少 3 天以降低淀粉含量,否則淀粉顆粒將干擾線粒體的純化。
3.一次實(shí)驗(yàn)需要 40 mL 勻漿液、約 90 mL 洗滌液和 35 mL 密度梯度離心介質(zhì)(配制方式是一次性將 9.8g (8.7mL) Percoll 加入到 26.3mL 離心介質(zhì)溶液中,充分混勻后得到 35mL 密度梯度離心介質(zhì))。這三種溶液用前均需要加入 BSA 干粉使其終濃度為 0.1%(100mL 溶液加 0.1g BSA 干粉,輕柔顛倒混勻或攪拌溶解后放冰上預(yù)冷待用)。每次實(shí)驗(yàn)用多少配多少,不要預(yù)先將所有 BSA 干粉加入, 否則容易長菌。
二:線粒體粗提操作流程
1.將 10 g 的綠色植物組織(如去葉脈后的嫩葉子,愈傷組織)或 20 g 干凈的非綠色植物組織(如發(fā)芽組織、根、塊莖等)浸泡在冰水中 10 分鐘,用紙吸干液體后浸泡在預(yù)冷的 40 mL 勻漿液(需先加 0.1% BSA)中,在浸泡狀態(tài)下剪成 1cm2大小的碎片。注意:如果樣品可分成多組平行處理,得到線粒體粗提物后再匯集, 否則線粒體產(chǎn)率將急劇降低。
2.將勻漿液和其中的植物組織碎片轉(zhuǎn)移到 Waring 勻漿器中,中速勻漿 3 次,每次
15 秒,每次之間間隔 10 秒以便讓碎片沉淀下來到刀片處。也可使用研磨法。具
體操作是將勻漿液和其中的植物組織碎片轉(zhuǎn)移到預(yù)冷的研缽中,研磨 3-4 分鐘。注意:植物組織勻漿后釋放的物質(zhì)會(huì)使勻漿液酸化,降低 pH,而線粒體對 pH 變化非常敏感,因此建議勻漿后用 pH 試紙檢測勻漿液的 pH,如果低于 7.0,必須用自備的 5 M KOH 將 pH 調(diào)到 7.0 以上才進(jìn)入下一步。
3.用帶柄尼龍篩過濾勻漿液,穿透液可通過預(yù)冷的漏斗收集到預(yù)冷的 50 mL 的塑料離心管中。帶柄尼龍篩可以洗干凈后可以反復(fù)使用。
4.在低速固定角度冷凍離心機(jī)上 4℃ 1000 g 離心 5 分鐘,沉淀為未破碎的細(xì)胞、破碎細(xì)胞的碎片、細(xì)胞核和淀粉顆粒,上清含線粒體。小心轉(zhuǎn)移上清到新的預(yù)冷的 50mL 塑料離心管中。
5.將裝上清的離心管在水平冷凍離心機(jī)上 4℃ 12,000 g 離心 20 分鐘,棄上清液, 所得棕綠色沉淀即為純化的線粒體粗提物。有時(shí)沉淀底部還有白色的淀粉沉淀, 屬于正常現(xiàn)象。
6.加入 10 mL 預(yù)冷的洗滌液(需先加 0.1% BSA,下同)中,用軟毛筆輕柔重懸線粒體沉淀(如果最底下有白色淀粉沉淀,需要避免重懸之)。不能劇烈震蕩,否則線粒體容易破裂。
7.將線粒體重懸液轉(zhuǎn)移到新的 50mL 離心管中,再加入 30mL 預(yù)冷的洗滌液(終體積為 40 mL)中,4℃ 1000 g 離心 5 分鐘。線粒體將在上清中。
8.將上清轉(zhuǎn)移到新的預(yù)冷的 50mL 離心管中,4℃ 12000 g 離心 20 分鐘,沉淀為線粒體。小心棄上清。到此步時(shí),線粒體回收率一般在 15-30%。
9.在沉淀中加入 2 mL 預(yù)冷的洗滌液。用軟毛筆輕柔重懸,得到線粒體粗提液。如果有平行提取,可將最多 4 管線粒體沉淀重懸在 2 mL 洗滌液中。線粒體粗提液中線粒體的回收率一般在 45-75%。
10.所得線粒體粗提液含其他細(xì)胞器(如類囊體膜, 質(zhì)體, 過氧化物酶體, 乙醛酸循環(huán)體,或細(xì)菌)污染,但可直接用于 PCR 級(jí)線粒體 DNA 和 RNA 的提取、呼吸鏈功能測定、蛋白濃度測定和線粒體精提。如果需要長期保存,則可以在線粒體重懸液中加入 1/20 體積的自備 DMSO,混勻后分成 0.5 mL/管,然后放-80℃保存。如此保存的線粒體酶活性和膜完整性在幾年內(nèi)都不會(huì)發(fā)生變化。
三:細(xì)胞核 DNA 的去除(純化測序級(jí)的線粒體 DNA 才需要進(jìn)行此操作。本產(chǎn)品不
提供相關(guān)試劑,實(shí)驗(yàn)步驟僅供參考)
11.預(yù)留 50uL 線粒體粗提液做對照,在約 2 mL 剩余的線粒體粗提液中加入 40 uL 25mM 的 MgCl2,再加入 200ug DNase 干粉或溶液(總量為 200ug 即可),混勻后冰上放置 60 分鐘降解 DNA。取少量樣品(如 50uL)在 PCR 儀器中加熱到 95℃變性 10 分鐘滅活 DNase,再取其中的 10uL 和 10uL 預(yù)留的樣品一起進(jìn)行細(xì)胞核基因?qū)R恍?PCR,如果 DNase 處理的樣品沒有擴(kuò)增,而預(yù)留樣品有擴(kuò)增,則表明 DNA 去除比較干凈(達(dá)到 PCR 檢測的極限),則進(jìn)入下一步。如果未去除干凈,則繼續(xù)在冰上放置,直到 PCR 檢測不到細(xì)胞核 DNA。
12.加入 0.32 mL 預(yù)冷的自備 0.5M 的 EDTA 溶液和 40mL 預(yù)冷的洗滌液。
13.4℃ 1000 g 離心 5 分鐘,將上清轉(zhuǎn)移到新的預(yù)冷的 50mL 離心管中,4℃ 12000g 離心 20 分鐘,沉淀為去除細(xì)胞核 DNA 的線粒體。重懸在 2mL 洗滌液中。四:線粒體精提操作方案(需要 40000g 的超速冷凍離心機(jī))
14.在 50 mL 預(yù)冷的塑料離心管中先后加入 35 mL 預(yù)冷的密度梯度離心介質(zhì)(配制方法見第三步,用前需先加 0.1% BSA)。
15.將 2 mL 線粒體粗提物重懸液鋪在密度梯度離心介質(zhì)上。
16.在超速水平離心機(jī)上 4℃ 40,000 g 離心 45 分鐘,最上層為黃色或橙色的質(zhì)體帶(如果材料是綠色植物,此帶將是綠色),其下的白色不透明的帶即為線粒體,管底沉淀為過氧化物酶體。其示意圖如下:
17.用廣口吸管(可將 1 mL 藍(lán)搶頭中間剪斷后使用)收集線粒體帶,注意避開其上的質(zhì)體帶過氧化物酶體沉淀,估計(jì)所取含線粒體溶液的體積。
18.在 15-20 分鐘的時(shí)間內(nèi)緩慢加入至少 4 倍體積的預(yù)冷的洗滌液。
19.轉(zhuǎn)入 50 mL 塑料管離心管中,在冷凍離心機(jī)上 4℃ 15,000 g 離心 20 分鐘,沉淀為線粒體。
20.將線粒體沉淀用軟毛筆小心重懸在至少 4 倍體積的預(yù)冷的洗滌液中,在冷凍離心機(jī)上 4℃ 15,000 g 離心 20 分鐘,棄上清,沉淀即為洗滌后的線粒體精提物。到此步時(shí),線粒體回收率一般在 5-15%。
21.將精提的線粒體重懸在 1mL 預(yù)冷的洗滌液中。重懸的線粒體可以立即使用,在冰上最多可放置 5-6 小時(shí)。如果需要長期保存,則可以在線粒體重懸液中加入1/20 體積的 DMSO,混勻后分成 0.5 mL/管,然后放-80℃保存。如此保存的線粒體酶活性和膜完整性在幾年內(nèi)都不會(huì)發(fā)生變化。
五:線粒體后續(xù)處理(本產(chǎn)品不提供相關(guān)試劑,實(shí)驗(yàn)步驟僅供參考)
22.DNA 提。弘x心得線粒體沉淀,再按常規(guī)的 SDS-蛋白酶 K 酶解,酚氯仿抽提, 乙醇-鹽沉淀的方法制備線粒體 DNA。也可以用細(xì)菌 DNA 提取的試劑盒制備DNA。
23.RNA 提。弘x心得線粒體沉淀,再按常規(guī)的 Trizol 方法制備線粒體 RNA。
24.總蛋白提。喊醇(xì)菌總蛋白提取方法。
25.線粒體內(nèi)膜,外膜、基質(zhì)純化:請自備方法。
26.其他功能檢測:請自備方法。
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