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pKD46

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 基本信息

啟動(dòng)子:araBAD

復(fù)制子:pSC101

終止子:λ tL3 terminator

原核抗性:Amp

克隆菌株:DH5a

培養(yǎng)條件:30度

表達(dá)宿主:大腸桿菌

誘導(dǎo)方式:阿拉伯糖

載體宿主:大腸桿菌

載體用途:基因敲除

基因類型:Red

原核抗性:Amp

質(zhì)粒簡(jiǎn)介

        pKD46質(zhì)粒是目前應(yīng)用最廣泛的Red同源重組質(zhì)粒,該質(zhì)粒含有受阿拉伯糖啟動(dòng)子調(diào)控的exo、bet、gam基因,其復(fù)制子為低拷貝溫敏型復(fù)制子,便于質(zhì)粒的消除。

與同源重組基因敲除相關(guān)的3個(gè)酶:

        1、Exo蛋白:Exo蛋白是一種核酸外切酶,單亞基的分子量為24 kD,Exo蛋白的活性形式是一種環(huán)狀三聚物分子,中間有一中空的通道,通道的一端可容納雙鏈DNA分子,另一端只可容納單鏈DNA。Exo蛋白可結(jié)合在雙鏈DNA的末端,從DNA雙鏈的5’端向3’端降解DNA,使DNA分子形成3’粘性末端。

        2、Beta蛋白:Beta蛋白在Red同源重組中起著決定性作用,具有介導(dǎo)互補(bǔ)單鏈DNA退火的功能,是一種退火蛋白,單亞基的分子量為25.8 kD。在溶液中,Beta蛋白自發(fā)地形成環(huán)狀結(jié)構(gòu),緊緊地結(jié)合在單鏈DNA的3’突出端,防止DNA被單鏈核酸酶降解,并介導(dǎo)互補(bǔ)單鏈DNA的退火。雙鏈DNA退火完成后,Beta蛋白從DNA雙鏈上解離下來(lái)。

        3、Gam蛋白:Gam蛋白為16kD的多肽分子,可與RecBCD核酸外切酶結(jié)合,抑制其對(duì)外源DNA的降解作用,防止外源DNA 進(jìn)入細(xì)胞后被宿主降解。

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